Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKCGP05129 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCGP05129 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCGP05129 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms