Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ASS1P00966 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASS1P00966 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ASS1P00966 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ASS1P00966 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ASS1P00966 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ASS1P00966 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ASS1P00966 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ASS1P00966 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ASS1P00966 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ASS1P00966 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASS1P00966 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ASS1P00966 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms