Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F13A1P00488 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F13A1P00488 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
F13A1P00488 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
F13A1P00488 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
F13A1P00488 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
F13A1P00488 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
F13A1P00488 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F13A1P00488 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F13A1P00488 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
F13A1P00488 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F13A1P00488 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
F13A1P00488 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
F13A1P00488 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
F13A1P00488 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
F13A1P00488 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
F13A1P00488 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
F13A1P00488 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
F13A1P00488 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
F13A1P00488 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
F13A1P00488 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
F13A1P00488 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
F13A1P00488 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
F13A1P00488 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms