Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GGPS1O95749 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGPS1O95749 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms