Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CBX6O95503 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CBX6O95503 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CBX6O95503 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CBX6O95503 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX6O95503 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX6O95503 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX6O95503 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX6O95503 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CBX6O95503 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX6O95503 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX6O95503 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX6O95503 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX6O95503 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX6O95503 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX6O95503 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX6O95503 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CBX6O95503 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CBX6O95503 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CBX6O95503 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CBX6O95503 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CBX6O95503 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CBX6O95503 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms