Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCATO75600 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCATO75600 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCATO75600 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCATO75600 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCATO75600 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCATO75600 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCATO75600 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCATO75600 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCATO75600 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCATO75600 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms