Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIA2O75334 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA2O75334 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA2O75334 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms