Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP3LO60238 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP3LO60238 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP3LO60238 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms