Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTN4O43707 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTN4O43707 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms