Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCK2O43639 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCK2O43639 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCK2O43639 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCK2O43639 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK2O43639 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK2O43639 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK2O43639 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK2O43639 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK2O43639 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK2O43639 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCK2O43639 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCK2O43639 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCK2O43639 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCK2O43639 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCK2O43639 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCK2O43639 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCK2O43639 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCK2O43639 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NCK2O43639 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK2O43639 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK2O43639 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK2O43639 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK2O43639 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCK2O43639 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCK2O43639 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCK2O43639 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCK2O43639 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCK2O43639 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCK2O43639 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCK2O43639 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCK2O43639 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCK2O43639 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK2O43639 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK2O43639 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK2O43639 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK2O43639 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK2O43639 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK2O43639 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK2O43639 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCK2O43639 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms