Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HTRA2O43464 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HTRA2O43464 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA2O43464 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms