Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRXO43186 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CRXO43186 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRXO43186 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRXO43186 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRXO43186 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRXO43186 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRXO43186 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms