Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PLXNB1O43157 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLXNB1O43157 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms