Protein–RNA interactions for Protein: O15523

DDX3Y, ATP-dependent RNA helicase DDX3Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3YO15523 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDX3YO15523 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX3YO15523 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms