Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2DO15514 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR2DO15514 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR2DO15514 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms