Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACOX3O15254 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACOX3O15254 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACOX3O15254 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACOX3O15254 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACOX3O15254 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ACOX3O15254 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACOX3O15254 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACOX3O15254 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACOX3O15254 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACOX3O15254 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACOX3O15254 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACOX3O15254 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACOX3O15254 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACOX3O15254 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACOX3O15254 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACOX3O15254 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms