Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ARPC1BO15143 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARPC1BO15143 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARPC1BO15143 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARPC1BO15143 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARPC1BO15143 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms