Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TXNDC9O14530 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TXNDC9O14530 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TXNDC9O14530 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC9O14530 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC9O14530 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC9O14530 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TXNDC9O14530 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms