Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TULP1O00294 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP1O00294 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP1O00294 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP1O00294 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP1O00294 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP1O00294 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TULP1O00294 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TULP1O00294 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TULP1O00294 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TULP1O00294 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TULP1O00294 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TULP1O00294 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TULP1O00294 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TULP1O00294 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP1O00294 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms