Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGPSO00116 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGPSO00116 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGPSO00116 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGPSO00116 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGPSO00116 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGPSO00116 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGPSO00116 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGPSO00116 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGPSO00116 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGPSO00116 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGPSO00116 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGPSO00116 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGPSO00116 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGPSO00116 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGPSO00116 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGPSO00116 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGPSO00116 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGPSO00116 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AGPSO00116 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AGPSO00116 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AGPSO00116 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms