Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
J3KT08 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
J3KT08 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
J3KT08 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KT08 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KT08 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
J3KT08 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
J3KT08 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
J3KT08 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
J3KT08 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms