Protein–RNA interactions for Protein: H7C1Q1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1Q1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1Q1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1Q1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1Q1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1Q1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1Q1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1Q1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
H7C1Q1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
H7C1Q1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
H7C1Q1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
H7C1Q1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
H7C1Q1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
H7C1Q1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
H7C1Q1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
H7C1Q1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H7C1Q1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H7C1Q1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H7C1Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H7C1Q1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
H7C1Q1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
H7C1Q1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms