Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H3BQF6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQF6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQF6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQF6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQF6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQF6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQF6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H3BQF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQF6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQF6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQF6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQF6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQF6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H3BQF6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQF6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQF6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H3BQF6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQF6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQF6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQF6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQF6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQF6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H3BQF6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H3BQF6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H3BQF6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H3BQF6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H3BQF6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H3BQF6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H3BQF6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQF6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQF6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQF6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQF6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H3BQF6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms