Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PALM2-AKAP2B1ALY0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms