Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP27XA6NNY8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP27XA6NNY8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP27XA6NNY8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms