Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf118A6NHY6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms