Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HMX3A6NHT5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HMX3A6NHT5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms