Protein–RNA interactions for Protein: A6NGA9

TMEM202, Transmembrane protein 202, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM202A6NGA9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM202A6NGA9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM202A6NGA9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms