Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOLGA6CA6NDK9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GOLGA6CA6NDK9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms