Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EME2A4GXA9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME2A4GXA9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms