Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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