Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y221

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIP7Q9Y221 SLC38A2-205ENST00000548236 865 ntTSL 23.37□□□□□ -1.873e-6■■■■■ 33.7
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NIP7Q9Y221 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-20■■■■■ 33.4
NIP7Q9Y221 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.333e-20■■■■■ 33.4
NIP7Q9Y221 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.587e-6■■■■■ 33.4
NIP7Q9Y221 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.017e-6■■■■■ 33.4
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NIP7Q9Y221 PMF1-206ENST00000606952 1275 ntTSL 1 (best)20.61■□□□□ 0.897e-6■■■■■ 33.4
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NIP7Q9Y221 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.467e-6■■■■■ 33.4
NIP7Q9Y221 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.297e-6■■■■■ 33.4
NIP7Q9Y221 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.287e-6■■■■■ 33.4
NIP7Q9Y221 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.127e-6■■■■■ 33.4
NIP7Q9Y221 PMF1-204ENST00000466489 933 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.397e-6■■■■■ 33.4
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NIP7Q9Y221 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 32.3
NIP7Q9Y221 ATG16L1-208ENST00000419681 644 ntTSL 521.22■□□□□ 0.998e-19■■■■■ 31.6
NIP7Q9Y221 ATG16L1-217ENST00000492298 591 ntTSL 514.2□□□□□ -0.148e-19■■■■■ 31.6
NIP7Q9Y221 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC8.32□□□□□ -1.088e-19■■■■■ 31.6
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NIP7Q9Y221 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.438e-13■■■■■ 30.8
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NIP7Q9Y221 RPS20-209ENST00000521289 737 ntTSL 514.7□□□□□ -0.062e-61■■■■■ 27.2
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NIP7Q9Y221 RPS20-201ENST00000009589 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-61■■■■■ 27.2
NIP7Q9Y221 RPS20-204ENST00000519606 424 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.612e-61■■■■■ 27.2
NIP7Q9Y221 RPS20-206ENST00000520490 402 ntTSL 310.34□□□□□ -0.752e-61■■■■■ 27.2
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NIP7Q9Y221 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.814e-44■■■■■ 26.8
NIP7Q9Y221 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 29.56□□□□□ -0.884e-44■■■■■ 26.8
NIP7Q9Y221 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.094e-44■■■■■ 26.8
NIP7Q9Y221 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.294e-44■■■■■ 26.8
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