Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SYNRGQ9UMZ2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SYNRGQ9UMZ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNRGQ9UMZ2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SYNRGQ9UMZ2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNRGQ9UMZ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNRGQ9UMZ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SYNRGQ9UMZ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SYNRGQ9UMZ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNRGQ9UMZ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SYNRGQ9UMZ2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNRGQ9UMZ2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SYNRGQ9UMZ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SYNRGQ9UMZ2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SYNRGQ9UMZ2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SYNRGQ9UMZ2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SYNRGQ9UMZ2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNRGQ9UMZ2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SYNRGQ9UMZ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SYNRGQ9UMZ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SYNRGQ9UMZ2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SYNRGQ9UMZ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SYNRGQ9UMZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SYNRGQ9UMZ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SYNRGQ9UMZ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SYNRGQ9UMZ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SYNRGQ9UMZ2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SYNRGQ9UMZ2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SYNRGQ9UMZ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SYNRGQ9UMZ2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SYNRGQ9UMZ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SYNRGQ9UMZ2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYNRGQ9UMZ2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SYNRGQ9UMZ2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SYNRGQ9UMZ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYNRGQ9UMZ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SYNRGQ9UMZ2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SYNRGQ9UMZ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SYNRGQ9UMZ2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SYNRGQ9UMZ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SYNRGQ9UMZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNRGQ9UMZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNRGQ9UMZ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SYNRGQ9UMZ2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
SYNRGQ9UMZ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SYNRGQ9UMZ2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SYNRGQ9UMZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SYNRGQ9UMZ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SYNRGQ9UMZ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYNRGQ9UMZ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYNRGQ9UMZ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYNRGQ9UMZ2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYNRGQ9UMZ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYNRGQ9UMZ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYNRGQ9UMZ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SYNRGQ9UMZ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYNRGQ9UMZ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms