Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC23A1Q9UHI7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC23A1Q9UHI7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC23A1Q9UHI7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC23A1Q9UHI7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC23A1Q9UHI7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC23A1Q9UHI7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC23A1Q9UHI7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC23A1Q9UHI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A1Q9UHI7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC23A1Q9UHI7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A1Q9UHI7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC23A1Q9UHI7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC23A1Q9UHI7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A1Q9UHI7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC23A1Q9UHI7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC23A1Q9UHI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC23A1Q9UHI7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC23A1Q9UHI7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A1Q9UHI7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A1Q9UHI7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A1Q9UHI7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A1Q9UHI7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A1Q9UHI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC23A1Q9UHI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A1Q9UHI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A1Q9UHI7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC23A1Q9UHI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC23A1Q9UHI7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC23A1Q9UHI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC23A1Q9UHI7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC23A1Q9UHI7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC23A1Q9UHI7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC23A1Q9UHI7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC23A1Q9UHI7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A1Q9UHI7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC23A1Q9UHI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC23A1Q9UHI7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC23A1Q9UHI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC23A1Q9UHI7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC23A1Q9UHI7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC23A1Q9UHI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms