Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTR3BQ9P1U1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTR3BQ9P1U1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTR3BQ9P1U1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTR3BQ9P1U1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACTR3BQ9P1U1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACTR3BQ9P1U1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACTR3BQ9P1U1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTR3BQ9P1U1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACTR3BQ9P1U1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTR3BQ9P1U1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACTR3BQ9P1U1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACTR3BQ9P1U1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACTR3BQ9P1U1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACTR3BQ9P1U1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACTR3BQ9P1U1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTR3BQ9P1U1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACTR3BQ9P1U1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTR3BQ9P1U1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACTR3BQ9P1U1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ACTR3BQ9P1U1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACTR3BQ9P1U1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTR3BQ9P1U1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTR3BQ9P1U1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACTR3BQ9P1U1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTR3BQ9P1U1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACTR3BQ9P1U1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACTR3BQ9P1U1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACTR3BQ9P1U1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTR3BQ9P1U1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACTR3BQ9P1U1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACTR3BQ9P1U1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTR3BQ9P1U1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACTR3BQ9P1U1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTR3BQ9P1U1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ACTR3BQ9P1U1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACTR3BQ9P1U1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACTR3BQ9P1U1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTR3BQ9P1U1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTR3BQ9P1U1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTR3BQ9P1U1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTR3BQ9P1U1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTR3BQ9P1U1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTR3BQ9P1U1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTR3BQ9P1U1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTR3BQ9P1U1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms