Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCKIPSDQ9NZQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NCKIPSDQ9NZQ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NCKIPSDQ9NZQ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NCKIPSDQ9NZQ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCKIPSDQ9NZQ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NCKIPSDQ9NZQ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCKIPSDQ9NZQ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NCKIPSDQ9NZQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCKIPSDQ9NZQ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCKIPSDQ9NZQ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCKIPSDQ9NZQ3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NCKIPSDQ9NZQ3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NCKIPSDQ9NZQ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NCKIPSDQ9NZQ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCKIPSDQ9NZQ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCKIPSDQ9NZQ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms