Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 DISC1-207ENST00000422590 2939 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.761e-17■■■■■ 60.4
FAM120AQ9NZB2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-17■■■■■ 60.4
FAM120AQ9NZB2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-17■■■■■ 60.4
FAM120AQ9NZB2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.081e-17■■■■■ 60.4
FAM120AQ9NZB2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-17■■■■■ 60.4
FAM120AQ9NZB2 DISC1-208ENST00000427560 545 ntTSL 38.21□□□□□ -1.11e-17■■■■■ 60.4
FAM120AQ9NZB2 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.097e-10■■■■■ 60.1
FAM120AQ9NZB2 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.097e-10■■■■■ 60.1
FAM120AQ9NZB2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 60.1
FAM120AQ9NZB2 CNN2-207ENST00000565096 2109 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.427e-10■■■■■ 60.1
FAM120AQ9NZB2 PIP4K2B-203ENST00000617781 927 ntTSL 212.8□□□□□ -0.362e-11■■■■■ 59.2
FAM120AQ9NZB2 SNX12-203ENST00000465030 946 ntTSL 217.72■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 59.2
FAM120AQ9NZB2 AP2A2-205ENST00000525796 551 ntTSL 521.42■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 58.4
FAM120AQ9NZB2 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 216.45■□□□□ 0.224e-10■■■■■ 58.4
FAM120AQ9NZB2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.933e-13■■■■■ 58.2
FAM120AQ9NZB2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.253e-13■■■■■ 58.2
FAM120AQ9NZB2 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 58.1
FAM120AQ9NZB2 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.024e-9■■■■■ 58
FAM120AQ9NZB2 C3-209ENST00000597442 469 ntTSL 313.05□□□□□ -0.322e-12■■■■■ 57.7
FAM120AQ9NZB2 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 319.28■□□□□ 0.682e-12■■■■■ 57.6
FAM120AQ9NZB2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-12■■■■■ 57.6
FAM120AQ9NZB2 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-12■■■■■ 57.6
FAM120AQ9NZB2 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.462e-12■■■■■ 57.6
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-207ENST00000548989 1976 ntTSL 219.35■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 57.1
FAM120AQ9NZB2 RNASEH1-203ENST00000454734 749 ntTSL 317.46■□□□□ 0.394e-13■■■■■ 56.9
FAM120AQ9NZB2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 56.7
FAM120AQ9NZB2 MINK1-209ENST00000574453 4941 ntTSL 1 (best)16.84■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 56.7
FAM120AQ9NZB2 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 516.42■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 56.7
FAM120AQ9NZB2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 56.7
FAM120AQ9NZB2 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 56.7
FAM120AQ9NZB2 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 511.1□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 56.7
FAM120AQ9NZB2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 56.6
FAM120AQ9NZB2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 56.6
FAM120AQ9NZB2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 56.6
FAM120AQ9NZB2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 56.6
FAM120AQ9NZB2 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 56.6
FAM120AQ9NZB2 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-8■■■■■ 56.6
FAM120AQ9NZB2 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 216.37■□□□□ 0.215e-25■■■■■ 56.5
FAM120AQ9NZB2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 55.8
FAM120AQ9NZB2 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)18.63■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 55.8
FAM120AQ9NZB2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 55.8
FAM120AQ9NZB2 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 55.8
FAM120AQ9NZB2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 55.8
FAM120AQ9NZB2 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 55.8
FAM120AQ9NZB2 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)14.8□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 55.8
FAM120AQ9NZB2 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.182e-59■■■■■ 55.6
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-206ENST00000548923 582 ntTSL 317.1■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 55.6
FAM120AQ9NZB2 TCF25-208ENST00000563032 274 ntTSL 222.29■■□□□ 1.164e-8■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 TCF25-212ENST00000564652 860 ntTSL 321.91■■□□□ 1.14e-8■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.664e-8■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 TCF25-203ENST00000561585 981 ntTSL 218.91■□□□□ 0.624e-8■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 TCF25-214ENST00000565196 655 ntTSL 517.98■□□□□ 0.474e-8■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.79e-8■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.279e-9■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.89□□□□□ -1.479e-9■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-21■■■■■ 55.5
FAM120AQ9NZB2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.214e-7■■■■■ 55.1
FAM120AQ9NZB2 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 55.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-207ENST00000472591 554 ntTSL 411.7□□□□□ -0.542e-9■■■■■ 54.9
FAM120AQ9NZB2 PQLC1-210ENST00000589452 704 ntTSL 531.38■■■□□ 2.614e-8■■■■■ 54.5
FAM120AQ9NZB2 PQLC1-214ENST00000593030 764 ntTSL 528.23■■■□□ 2.114e-8■■■■■ 54.5
FAM120AQ9NZB2 PQLC1-213ENST00000591964 856 ntTSL 327.72■■■□□ 2.034e-8■■■■■ 54.5
FAM120AQ9NZB2 PQLC1-207ENST00000478144 409 ntTSL 313.01□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 54.5
FAM120AQ9NZB2 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 314.57□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 54.3
FAM120AQ9NZB2 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 414.21□□□□□ -0.134e-11■■■■■ 54.1
FAM120AQ9NZB2 AL390719.1-206ENST00000451054 565 ntTSL 213.29□□□□□ -0.283e-9■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 AL390719.1-205ENST00000433695 540 ntTSL 212.37□□□□□ -0.433e-9■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 PNPLA7-203ENST00000434090 2419 ntTSL 516.09■□□□□ 0.178e-8■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.378e-8■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.451e-6■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-210ENST00000551836 627 ntTSL 326.24■■□□□ 1.791e-6■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-211ENST00000552643 1383 ntTSL 225.87■■□□□ 1.731e-6■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-204ENST00000547643 1373 ntTSL 324■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-203ENST00000538259 991 ntTSL 221.04■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 CRIP2-208ENST00000550577 817 ntTSL 212.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 53.9
FAM120AQ9NZB2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 53.5
FAM120AQ9NZB2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.257e-15■■■■■ 53.3
FAM120AQ9NZB2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.887e-15■■■■■ 53.3
FAM120AQ9NZB2 CASP9-207ENST00000447522 954 ntTSL 319.81■□□□□ 0.767e-15■■■■■ 53.3
FAM120AQ9NZB2 CASP9-208ENST00000469637 725 ntTSL 315.06■□□□□ 07e-15■■■■■ 53.3
FAM120AQ9NZB2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.12e-9■■■■■ 53.1
FAM120AQ9NZB2 EFNA1-204ENST00000474413 1083 ntTSL 319.31■□□□□ 0.682e-9■■■■■ 53.1
FAM120AQ9NZB2 EFNA1-203ENST00000469878 1288 ntTSL 314.76□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 53.1
FAM120AQ9NZB2 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 53.1
FAM120AQ9NZB2 POLR1A-210ENST00000496892 546 ntTSL 415.05■□□□□ -01e-7■■■■■ 52.8
FAM120AQ9NZB2 POLR1A-209ENST00000492034 588 ntTSL 414.51□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 52.8
FAM120AQ9NZB2 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 52.8
FAM120AQ9NZB2 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.313e-9■■■■■ 52.8
FAM120AQ9NZB2 MXI1-206ENST00000442296 634 ntTSL 513.64□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 52.8
FAM120AQ9NZB2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.885e-10■■■■■ 52.8
FAM120AQ9NZB2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.227e-7■■■■■ 52.7
FAM120AQ9NZB2 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 52.6
FAM120AQ9NZB2 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.77e-7■■■■■ 52.6
FAM120AQ9NZB2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-10■■■■■ 52.6
FAM120AQ9NZB2 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 326.56■■□□□ 1.844e-12■■■■■ 52.5
FAM120AQ9NZB2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.974e-12■■■■■ 52.5
FAM120AQ9NZB2 DCUN1D4-215ENST00000509068 805 ntTSL 323.88■■□□□ 1.418e-8■■■■■ 52.4
FAM120AQ9NZB2 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.111e-14■■■■■ 52.2
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 57.3 ms