Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSENENQ9NZ42 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSENENQ9NZ42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSENENQ9NZ42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSENENQ9NZ42 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSENENQ9NZ42 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSENENQ9NZ42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSENENQ9NZ42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSENENQ9NZ42 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSENENQ9NZ42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSENENQ9NZ42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSENENQ9NZ42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSENENQ9NZ42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSENENQ9NZ42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSENENQ9NZ42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSENENQ9NZ42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSENENQ9NZ42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSENENQ9NZ42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSENENQ9NZ42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSENENQ9NZ42 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSENENQ9NZ42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSENENQ9NZ42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSENENQ9NZ42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PSENENQ9NZ42 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms