Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDH8Q9NYR8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RDH8Q9NYR8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH8Q9NYR8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH8Q9NYR8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RDH8Q9NYR8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RDH8Q9NYR8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH8Q9NYR8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH8Q9NYR8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RDH8Q9NYR8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RDH8Q9NYR8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RDH8Q9NYR8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RDH8Q9NYR8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH8Q9NYR8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RDH8Q9NYR8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RDH8Q9NYR8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH8Q9NYR8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH8Q9NYR8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RDH8Q9NYR8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RDH8Q9NYR8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RDH8Q9NYR8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RDH8Q9NYR8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RDH8Q9NYR8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RDH8Q9NYR8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RDH8Q9NYR8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDH8Q9NYR8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RDH8Q9NYR8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH8Q9NYR8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH8Q9NYR8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RDH8Q9NYR8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDH8Q9NYR8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH8Q9NYR8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms