Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP5S1Q9NUS5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP5S1Q9NUS5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5S1Q9NUS5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5S1Q9NUS5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5S1Q9NUS5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP5S1Q9NUS5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP5S1Q9NUS5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP5S1Q9NUS5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AP5S1Q9NUS5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP5S1Q9NUS5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AP5S1Q9NUS5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AP5S1Q9NUS5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AP5S1Q9NUS5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
AP5S1Q9NUS5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP5S1Q9NUS5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP5S1Q9NUS5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP5S1Q9NUS5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AP5S1Q9NUS5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms