Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCF3Q9NUQ8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ABCF3Q9NUQ8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ABCF3Q9NUQ8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCF3Q9NUQ8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCF3Q9NUQ8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCF3Q9NUQ8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCF3Q9NUQ8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCF3Q9NUQ8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCF3Q9NUQ8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ABCF3Q9NUQ8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCF3Q9NUQ8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCF3Q9NUQ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCF3Q9NUQ8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCF3Q9NUQ8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCF3Q9NUQ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCF3Q9NUQ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCF3Q9NUQ8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCF3Q9NUQ8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCF3Q9NUQ8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCF3Q9NUQ8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCF3Q9NUQ8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCF3Q9NUQ8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCF3Q9NUQ8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCF3Q9NUQ8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCF3Q9NUQ8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ABCF3Q9NUQ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ABCF3Q9NUQ8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF3Q9NUQ8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms