Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A9Q9NUM3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A9Q9NUM3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A9Q9NUM3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A9Q9NUM3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A9Q9NUM3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A9Q9NUM3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC39A9Q9NUM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A9Q9NUM3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A9Q9NUM3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A9Q9NUM3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A9Q9NUM3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A9Q9NUM3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A9Q9NUM3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A9Q9NUM3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A9Q9NUM3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC39A9Q9NUM3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC39A9Q9NUM3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC39A9Q9NUM3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC39A9Q9NUM3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A9Q9NUM3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC39A9Q9NUM3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms