Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CYLDQ9NQC7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYLDQ9NQC7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYLDQ9NQC7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYLDQ9NQC7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYLDQ9NQC7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYLDQ9NQC7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYLDQ9NQC7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYLDQ9NQC7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYLDQ9NQC7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYLDQ9NQC7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYLDQ9NQC7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYLDQ9NQC7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYLDQ9NQC7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYLDQ9NQC7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYLDQ9NQC7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYLDQ9NQC7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYLDQ9NQC7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYLDQ9NQC7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYLDQ9NQC7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYLDQ9NQC7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYLDQ9NQC7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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