Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AKIP1Q9NQ31 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AKIP1Q9NQ31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AKIP1Q9NQ31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
AKIP1Q9NQ31 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AKIP1Q9NQ31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AKIP1Q9NQ31 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AKIP1Q9NQ31 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AKIP1Q9NQ31 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AKIP1Q9NQ31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AKIP1Q9NQ31 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKIP1Q9NQ31 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AKIP1Q9NQ31 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AKIP1Q9NQ31 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AKIP1Q9NQ31 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AKIP1Q9NQ31 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AKIP1Q9NQ31 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AKIP1Q9NQ31 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AKIP1Q9NQ31 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AKIP1Q9NQ31 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AKIP1Q9NQ31 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AKIP1Q9NQ31 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AKIP1Q9NQ31 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AKIP1Q9NQ31 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AKIP1Q9NQ31 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AKIP1Q9NQ31 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AKIP1Q9NQ31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AKIP1Q9NQ31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AKIP1Q9NQ31 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AKIP1Q9NQ31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AKIP1Q9NQ31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AKIP1Q9NQ31 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AKIP1Q9NQ31 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AKIP1Q9NQ31 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKIP1Q9NQ31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AKIP1Q9NQ31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms