Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DNAJC4Q9NNZ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DNAJC4Q9NNZ3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DNAJC4Q9NNZ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC4Q9NNZ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC4Q9NNZ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DNAJC4Q9NNZ3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC4Q9NNZ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DNAJC4Q9NNZ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DNAJC4Q9NNZ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC4Q9NNZ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC4Q9NNZ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC4Q9NNZ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DNAJC4Q9NNZ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DNAJC4Q9NNZ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DNAJC4Q9NNZ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DNAJC4Q9NNZ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC4Q9NNZ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC4Q9NNZ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC4Q9NNZ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC4Q9NNZ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC4Q9NNZ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC4Q9NNZ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC4Q9NNZ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC4Q9NNZ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAJC4Q9NNZ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DNAJC4Q9NNZ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAJC4Q9NNZ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms