Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC98

NEK6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6Q9HC98 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK6Q9HC98 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK6Q9HC98 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK6Q9HC98 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK6Q9HC98 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK6Q9HC98 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK6Q9HC98 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK6Q9HC98 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK6Q9HC98 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK6Q9HC98 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK6Q9HC98 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK6Q9HC98 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK6Q9HC98 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEK6Q9HC98 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEK6Q9HC98 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK6Q9HC98 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK6Q9HC98 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK6Q9HC98 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEK6Q9HC98 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK6Q9HC98 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK6Q9HC98 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK6Q9HC98 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK6Q9HC98 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK6Q9HC98 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK6Q9HC98 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK6Q9HC98 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEK6Q9HC98 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEK6Q9HC98 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEK6Q9HC98 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK6Q9HC98 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK6Q9HC98 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK6Q9HC98 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK6Q9HC98 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK6Q9HC98 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK6Q9HC98 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEK6Q9HC98 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK6Q9HC98 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK6Q9HC98 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK6Q9HC98 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK6Q9HC98 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms