Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAP6

LIN7B, Protein lin-7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7BQ9HAP6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN7BQ9HAP6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIN7BQ9HAP6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIN7BQ9HAP6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7BQ9HAP6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIN7BQ9HAP6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LIN7BQ9HAP6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN7BQ9HAP6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN7BQ9HAP6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7BQ9HAP6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN7BQ9HAP6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7BQ9HAP6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN7BQ9HAP6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7BQ9HAP6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN7BQ9HAP6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN7BQ9HAP6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN7BQ9HAP6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN7BQ9HAP6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN7BQ9HAP6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN7BQ9HAP6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN7BQ9HAP6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN7BQ9HAP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN7BQ9HAP6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN7BQ9HAP6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN7BQ9HAP6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIN7BQ9HAP6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms