Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5U6

ZCCHC4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC4Q9H5U6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZCCHC4Q9H5U6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC4Q9H5U6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC4Q9H5U6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC4Q9H5U6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC4Q9H5U6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC4Q9H5U6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC4Q9H5U6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC4Q9H5U6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC4Q9H5U6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZCCHC4Q9H5U6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZCCHC4Q9H5U6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC4Q9H5U6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZCCHC4Q9H5U6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZCCHC4Q9H5U6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZCCHC4Q9H5U6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZCCHC4Q9H5U6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZCCHC4Q9H5U6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC4Q9H5U6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZCCHC4Q9H5U6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC4Q9H5U6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC4Q9H5U6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC4Q9H5U6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC4Q9H5U6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC4Q9H5U6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZCCHC4Q9H5U6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZCCHC4Q9H5U6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZCCHC4Q9H5U6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZCCHC4Q9H5U6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms