Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLSTN2Q9H4D0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLSTN2Q9H4D0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLSTN2Q9H4D0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLSTN2Q9H4D0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLSTN2Q9H4D0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLSTN2Q9H4D0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CLSTN2Q9H4D0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CLSTN2Q9H4D0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CLSTN2Q9H4D0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLSTN2Q9H4D0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLSTN2Q9H4D0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLSTN2Q9H4D0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CLSTN2Q9H4D0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CLSTN2Q9H4D0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLSTN2Q9H4D0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLSTN2Q9H4D0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLSTN2Q9H4D0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLSTN2Q9H4D0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CLSTN2Q9H4D0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLSTN2Q9H4D0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CLSTN2Q9H4D0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CLSTN2Q9H4D0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLSTN2Q9H4D0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CLSTN2Q9H4D0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CLSTN2Q9H4D0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CLSTN2Q9H4D0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CLSTN2Q9H4D0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CLSTN2Q9H4D0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLSTN2Q9H4D0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLSTN2Q9H4D0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLSTN2Q9H4D0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CLSTN2Q9H4D0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLSTN2Q9H4D0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLSTN2Q9H4D0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLSTN2Q9H4D0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CLSTN2Q9H4D0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLSTN2Q9H4D0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CLSTN2Q9H4D0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLSTN2Q9H4D0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CLSTN2Q9H4D0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CLSTN2Q9H4D0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CLSTN2Q9H4D0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLSTN2Q9H4D0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLSTN2Q9H4D0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLSTN2Q9H4D0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLSTN2Q9H4D0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CLSTN2Q9H4D0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CLSTN2Q9H4D0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CLSTN2Q9H4D0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CLSTN2Q9H4D0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLSTN2Q9H4D0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CLSTN2Q9H4D0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CLSTN2Q9H4D0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLSTN2Q9H4D0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLSTN2Q9H4D0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLSTN2Q9H4D0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLSTN2Q9H4D0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLSTN2Q9H4D0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CLSTN2Q9H4D0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CLSTN2Q9H4D0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms