Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ACBD3Q9H3P7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ACBD3Q9H3P7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACBD3Q9H3P7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACBD3Q9H3P7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACBD3Q9H3P7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACBD3Q9H3P7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ACBD3Q9H3P7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACBD3Q9H3P7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACBD3Q9H3P7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACBD3Q9H3P7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ACBD3Q9H3P7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ACBD3Q9H3P7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACBD3Q9H3P7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACBD3Q9H3P7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ACBD3Q9H3P7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACBD3Q9H3P7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACBD3Q9H3P7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACBD3Q9H3P7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACBD3Q9H3P7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ACBD3Q9H3P7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ACBD3Q9H3P7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACBD3Q9H3P7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ACBD3Q9H3P7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACBD3Q9H3P7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACBD3Q9H3P7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACBD3Q9H3P7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACBD3Q9H3P7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACBD3Q9H3P7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ACBD3Q9H3P7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACBD3Q9H3P7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACBD3Q9H3P7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ACBD3Q9H3P7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACBD3Q9H3P7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACBD3Q9H3P7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACBD3Q9H3P7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACBD3Q9H3P7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACBD3Q9H3P7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACBD3Q9H3P7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACBD3Q9H3P7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACBD3Q9H3P7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACBD3Q9H3P7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACBD3Q9H3P7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACBD3Q9H3P7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACBD3Q9H3P7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ACBD3Q9H3P7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACBD3Q9H3P7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACBD3Q9H3P7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms